Да, совместная работа между отделами очень нужна. Так намного легче работать, слаженно и легко. Я думаю, что Вам нужна нормальная
интеграция 1С с другими системами. Тогда все будет работать как часики, без проблем. Мы сделали такую схему несколько лет назад и почувствовали значительную разницу с тем, что было раньше.